Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GIPC3Q8TF64 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms