Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms