Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms