Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms