Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms