Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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