Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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