Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRY1Q16526 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms