Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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