Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRP1BQ14684 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms