Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOFQ13790 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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