Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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C1orf61Q13536 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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C1orf61Q13536 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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C1orf61Q13536 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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C1orf61Q13536 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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C1orf61Q13536 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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