Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOS1Q07889 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms