Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms