Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms