Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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