Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME5P56597 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME5P56597 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME5P56597 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME5P56597 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME5P56597 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME5P56597 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME5P56597 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME5P56597 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME5P56597 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms