Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV3P56539 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV3P56539 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms