Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms