Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMPHP49418 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMPHP49418 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms