Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECI1P42126 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECI1P42126 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ECI1P42126 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms