Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms