Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms