Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms