Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms