Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HRCP23327 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HRCP23327 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HRCP23327 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HRCP23327 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HRCP23327 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HRCP23327 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms