Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms