Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNT1P13805 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms