Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOP1P11387 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP1P11387 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP1P11387 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOP1P11387 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP1P11387 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms