Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MSMBP08118 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
MSMBP08118 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MSMBP08118 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MSMBP08118 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MSMBP08118 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MSMBP08118 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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MSMBP08118 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MSMBP08118 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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MSMBP08118 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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MSMBP08118 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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MSMBP08118 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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