Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRB1P04280 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRB1P04280 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms