Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms