Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
ABCC9O60706 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ABCC9O60706 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC9O60706 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC9O60706 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms