Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms