Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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MBD3L5A6NJ08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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MBD3L5A6NJ08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L5A6NJ08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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