Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms