Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms