Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP3Q9Y3E7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP3Q9Y3E7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms