Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms