Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms