Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms