Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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