Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms