Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms