Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms