Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH6AQ9H0K4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms