Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NYXQ9GZU5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms