Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms