Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms