Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms